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Realice una factura pero no me percate que no se agrego el iva ni se disminuyeron las retenciones, obviamente cancele esa factura pero mi inquilino me deposito el total, es decir me deposito 465.04 de mas, que es lo que debo hacer. devolver la diferencia o devolver todo y que me deposite de manera correcta

Donde dejas dicho " obviamente cancele esa factura " , debemos entender que emitiste nueva "Factura rectificativa" según prevee la Ley del IVA y el propio Reglamento de Facturación.
El saldo acreedor que luce actualmente la cuenta de tu cliente, al haberte pagado el importe superior de la inicial factura, podrás compensarlo, en la más lógico de los procedimientos, acordando con tu inquilino que, en la pago de la próxima factura , se descuente el importe pagado en más de la anterior.