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Tengo la siguiente duda:

Situación
Anterior contable metía las adquisiciones intracomunitarias (servicios publicitarios) en el modelo 349 pero ni contabilizaba ni declaraba el correspondiente IVA soportado y autorepercutido intracomunitario en el modelo 303.

Pregunta
¿Es buena idea sumar en la declaración de IVA del 3T todo el IVA de las operaciones intracomunitarias de todo el año, es decir, no solo meter lo que corresponde a este trimestre, sino sumar también todo lo no declarado en su debido momento?

No es lo más correcto, pero no debes de tener problema con ello, siempre y cuando no estés sujeto a la regla de la prorrata, y te puedas deducir la totalidad del IVA soportado. En caso contrario lo correcto sería presentar complementarias ya que se produciría un diferimiento en la tributación.

Como comenta el compañero no de arriba, no deberías tener problemas.

Un saludo